（一）办公室（市国防动员委员会科技动员办公室、政策法规科、安全生产监管科）。负责机关日常运转，承担全局性会议组织、重要文件起草、机关文电处理、文书档案管理、办公自动化建设等工作；承担信息、安全、保密、信访、宣传、接待、政务公开、督查督办、干部人事、机构编制、劳动工资、教育培训、日常考核、离退休干部等工作；负责机关党建、党风廉政建设工作；负责机关及所属事业单位经费预决算、财务管理、资产账务管理工作；承担市国防动员委员会科技动员办公室的日常工作和科技拥军工作；承担科技相关规范性文件的合法性审查、行政复议、行政应诉等工作；拟订本部门、本行业落实安全生产责任制和相关法律法规的工作规划；指导本部门、本行业安全生产综合监管工作；组织开展本部门、本行业安全检查和专项检查；参与各类安全生产事故调查工作；综合协调本部门、本行业安全生产工作；联系产业安全生产工作等。
（二）高新技术科（创新发展科）。负责推进区域创新和创新型城市建设工作，指导创新型区镇建设；承担区域科技创新体系建设工作，负责全市高新技术产业开发区建设指导管理和协调服务；负责推进南通沿江科创带建设，协调全市科创项目引进培育工作；组织拟订全市科技创新发展规划和年度计划，全市高新技术发展及其产业化的计划和政策、牵头拟订市本级科技计划项目，制定市科技计划项目管理办法并协调实施；负责市本级科技发展资金的预决算和统筹安排，并配合有关部门对科技发展资金使用监督检查、审计和绩效评价；负责高新技术企业、技术先进性服务企业、科技创新型企业、民营科技企业等的组织申报和管理工作；组织实施省科技型创业企业孵育计划、高新技术企业培育资金等项目；扎口管理国家、省、市相关科技计划项目的申报和实施；负责科技统计、科技对口支援工作；协调科技军民融合发展相关工作；牵头全市科技体制改革和市科技工作综合考核工作；组织开展科技评估和监督检查、科研诚信建设工作；承担科技政策的培训和落实成效统计分析工作；组织实施软科学研究、全市科学普及、高新技术特色产业基地建设；组织开展科技企业孵化器及众创空间推荐和管理工作；推动科技创新创业投融资体系建设，承担推进科技与金融结合相关工作；牵头组织设立制造业产业技术创新战略联盟。
（三）科技成果科（科研机构科）。负责拟订产学研协同创新计划和政策，组织全市性产学研对接活动；负责全市科技合作工作，推动长三角区域科技合作，牵头对接上海科技创新工作；拟订科技成果产业化及产业技术创新、科技知识产权创造政策和措施并组织实施；负责省级以上科技成果转化资金项目计划的组织推荐和协助管理工作；负责全市科学技术奖励、外国专家奖励及社会力量设立科学技术奖等管理工作；拟订科技成果登记、评价、奖励、保密、推广的管理办法并组织实施；负责启东市科技兴市功臣的评审组织工作；负责科技社团、科技行业协会等相关管理工作；提出科技人才队伍建设规划和政策建议，参与相关人才计划实施工作；承担科技安全和科技保密相关工作；负责落实市科技基础设施、平台建设计划，重点实验室、技术创新中心等创新能力建设的支持政策；负责国家和省相关科技计划项目组织推荐和扎口管理；负责高层次科研院所引进工作；指导推进新型研发机构建设；拟订科技服务业发展规划和政策；承担全市技术转移机构建设；承担全市技术转移体系工作，推动科技服务业、技术市场和科技中介组织发展；负责全市大众创业万众创新工作，指导开展“双创”活动；负责科研技术装备、实验动物管理工作；联系沿海开发科技工作。负责综合管理全市引进国外智力和外国专家工作，拟订引进国外智力和外国专家规划、政策、计划并组织实施；推动建立重点外国专家、团队吸引集聚联系服务机制；拟订出国（境）培训规划、政策和年度计划并监督实施；承担外国人来365体育投注：工作、外国高端人才资质管理和服务保障；牵头科技国际合作，拟订国际科技合作交流的政策和措施并推动落实。
（四）农村科技与社会发展科。拟订和组织实施科技促进农业农村、社会发展的规划和政策，编制和组织实施市农业、社会发展类科技支撑计划，并负责组织实施相关政策；负责国家、省、南通市对应的科技计划项目的组织推荐和协助管理工作，推动重大关键技术攻关；组织实施现代农业科技创新工作，指导农业科技载体以及农业科技示范推广基地的建设；指导农业科技特色产业培育，负责科技特派员、科技扶贫工作，推动农业、农村科技进步和农村科技社会化服务体系建设；推动绿色技术创新和生态环境保护，开展科技应对气候变化工作；组织实施涉及资源环境、人口健康、公共安全、可持续发展综合实验区以及其他社会事业领域的科技工作；拟订基础研究计划和政策，组织申报国家、省基础研究（自然科学基金）计划。
（五）科技招商科。负责全市科技招商工作的统筹、协调、督查、考核等工作；负责拟定科技招商优惠政策和奖励兑现落实工作，宣传推介全市科技产业政策和投资环境；承接对外科技招商咨询和接待工作；负责推进科技型企业招引，摸排科技创新创业资源；负责科创项目招引洽谈、前置审查工作；引进高科技含量项目、高新技术企业、高端科创平台、高水平科研机构，加快发展高新技术产业；招引国内外企业和科创团队来启投资创业，兴办实体；招引从事高新技术产品研发、制造、服务等创新能力强和具有高成长潜力的科技型中小企业、高新技术企业、重点产业链上下游配套科技企业；负责科技招商中介等机构的联系和协调服务工作，对接科技风投、创投机构等专业投资机构招引科创项目，实现科创项目落地；对接国家级科研院所和重点高校科研成果，进行项目孵化，促进成果转化与落地；组织、参与指导乡镇（街道）、园区科创项目的推介、跟踪、服务等工作。
职数调整
调整后，市科学技术局内设机构领导职数8名，其中科长（主任）5名，副科长（副主任）3名。