启东市烟草专卖局（分公司）下设4个科室：
（1）办公室（安全管理科）
主任：黄柳燕 办公室电话：0513-83317903
副主任：沈婷婷办公室电话：0513-83353433
负责政务协调、会议管理、文档管理、宣传报道、保密管理、信访稳定等工作；负责实物资产、后勤服务、物业管理、车辆管理、基建管理等相关工作；负责干部人事、人才队伍、劳动工资、保险福利、教育培训等工作；负责党的建设、思想政治建设、精神文明建设、文化建设、工会群团建设等工作；负责消防安全、生产安全、交通安全、职业健康、内部治安、应急值守等安全生产管理工作的组织、协调、监督、检查和报告等工作。
（2）专卖管理科（专卖稽查大队、电子烟管理办）
科 长：陈勇 办公室电话：0513-83340655
副科长：邢天波 办公室电话：0513-83312322
负责本级综合事务、零售许可证管理、市场监管、案件稽查、案件审理、电子烟监督管理、12313管理、督查考评等工作。
（3）客户服务科
科长：陈春晓 办公室电话：0513-83321559
副科长：龚捷波 办公室电话：0513--83357807
按照上级的统一安排做好本辖区品牌培育、信息采集、市场监测、消费研究、网络建设等工作；负责本辖区客户服务管理工作等。
（4）法规科（监察科、内部专卖管理监督派驻组）
科长：王燕 办公室电话：0513-83319396
贯彻落实法律法规及上级有关烟草行业体制改革的政策措施；审核规范性文件等管理制度及重大决策；组织法律风险防控；处理诉讼仲裁等法律纠纷；负责专卖执法人员资格管理等法制监督工作；负责法治宣传教育工作。负责履行监督责任，协助党组加强党风建设和组织协调反腐败工作；督促检查相关部门落实惩治和预防腐败工作任务；强化监督执纪问责，受理对党员干部的检举、控告，严肃查处违规违纪问题，受理不服处分的申诉；负责精益管理、科技
创新、贯标、对标、QC等企业管理工作；组织实施绩效考核工作，检查各项工作目标完成情况；负责企业内部其他各项规章制度执行情况的检查；受理各种投诉、举报、意见及建议，组织相关部门查实处理。负责监督检查辖区行业内部生产经营企业遵守烟草专卖法律法规及行业规范的情况，组织实施辖区内部专卖管理监督工作；负责对辖区行业内部生产经营企业的日常监管，对违反烟草专卖法律法规生产经营问题的查处。